甄莹博士

Ying Zhen, Ph. D.

演化生态基因组实验室

联系

邮箱: zhenying@westlake.edu.cn

网站: http://www.zhen-lab.com

甄莹博士

Ying Zhen, Ph. D.

演化生态基因组实验室

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个人简介

甄莹,2003年在北京大学获得生命科学学士2009年在美国堪萨斯州立大学获得生物学博士2010年在美国普林斯顿大学生态与进化系从事博士后研究;2014年起在美国加州大学洛杉矶分校生态与进化系以及环境与可持续发展研究所做博士后于2018年底全职加入西湖大学生命科学学院 ,任研究员、博士生导师。


学术成果及研究方向

研究、保护、利用生物多样性,是人与自然和谐共生和长治久安的基础演化生物学和生态学作为生物学中最早发展的领域,致力于理解生命世界多样性的起源、历史和发展规律,在基础研究领域的重要性不言而喻T. Dobzhansky说,Nothing in biology makes sense except in the light of evolution。近年来,基因组大数据的迅速发展和普及,给传统的演化学和生态学带来了前所未有的机遇。科学家已经获得了大量模式物种的全基因组序列,对各种非模式生物基因组的研究方法也有了长足的进步,能够快速获得较以前多成千上万倍的基因组信息,使演化基因组学和生态基因组学成为目前基因组学中最为活跃的交叉方向之一。

甄莹博士以探索适应性演化的分子遗传机制为中心,结合基因组学大数据、生物信息学分析和分子遗传试验,在不同的模式和非模式生物体系中研究适应性演化的分子机制。主要发现包括:1)通过全新的模型和算法发现人与黑猩猩间分化的蛋白编码位点中至少20%是受正向选择所影响,并进一步发现人有比小鼠和果蝇更多更强的有益新突变;2)通过解析多种食草性昆虫对心脏干扰素的毒素耐受性的遗传机制发现了适应性演化有一定的可预测性3)用深度种群基因组学方法研究非洲热带雨林区域鸟类、昆虫、爬行类等多个物种的基因组多样性以及适应性演化,该结果正在被研究人员用以更好地规划和保护该区域现有的生物多样性。

这些基础研究帮助我们了解丰富多彩的自然界,不仅有重要的演化学生态学意义,而且对优化生态保护修复、新药及杀虫剂的开发提供理论基础。目前课题组主要研究方向包括但不限定于

1. 利用趋同演化体系更深入的研究适应性演化机制及其限制因素

2.理解不同生态环境下自然种群生物多样性发生规律及适应性演化机制

3. 解析全新性状演化的遗传发育基础及规则

代表论文

1. Ying Zhen#, Christian D. Huber, Robert W. Davies, Kirk E. Lohmueller#. Greater strength of selection and higher proportion of beneficial amino acid changing mutations in humans compared with mice and Drosophila melanogaster. Genome Research (2021). 31:110–120.

2. Ying Zhen#, Ryan J. Harrigan, Kristen Ruegg, Eric C. Anderson, Thomas C. Ng, Sirena Lao, Kirk E. Lohmueller, and Thomas B. Smith. Genomic divergence across ecological gradients in the Central African rainforest songbird (Andropadus virens). Molecular Ecology (2017). 26, 4966–4977

3. Ying Zhen, Matthew L Aardema, Edgar M Medina, Molly Schumer, Peter Andolfatto. Parallel molecular evolution in an herbivore community. Science (2012).337:1634-7.

4. Ying Zhen#, Preeti Dhakal and Mark C. Ungerer. Fitness benefits and costs of cold acclimation in Arabidopsis thaliana.American Naturalist (2011). Vol. 178, No. 1, pp. 44-52.

5. Ying Zhen, Mark C Ungerer. Relaxed selection on the CBF/DREB1 regulatory genes and reduced freezing tolerance in the southern range of Arabidopsis thaliana. Molecular Biology and Evolution (2008). 25(12):2547-55.  

6. Ying Zhen, Mark C Ungerer. Clinal variation in freezing tolerance among natural accessions of Arabidopsis thaliana. New Phytologist (2008). 177 (2), 419–427.


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